Казанский Богородицкий монастырь был основан в городе Барнаул в 1886 году и располагался по адресу: Канатный проезд, дом 81.

Изначально монастырь основывался как женский, но в 1900 году был преобразован в общежительный. В начале 20 века здесь были отстроены келейные корпуса, хозяйственные строения, организована школа для девочек. В 1895 году построена и освящена домовая церковь при монастыре, а уже в 1904 году был освящен новопостроенный собор Казанской иконы Божьей Матери. Еще через 3 года появился молитвенный дом в честь Владимирской иконы Божией Матери. Постепенно расширялись и территории монастыря, и уже к 1910 году он по праву назывался одной из самых крупных обителей Сибири. В это время в монастыре постоянно проживало порядка 150 человек. При Казанском Богородицком монастыре действовала церковно-приходская воскресная школа, в которой обучалось одновременно 25 человек.

В период советской власти Казанский Богородицкий монастырь был упразднен, закрыт и разорен, а игумения арестована и расстреляна. В настоящее время в здании бывшего монастыря располагается Следственный изолятор ФБУ ИЗ22/1 УФСИН России по Алтайскому краю.