Церковь Макария Алтайского (Глухарева) находится в столице Республики Алтай городе Горно-Алтайск. В 1828 году указом Синода была образована Алтайская Духовная миссия, благодаря которой началось зарождение православия на Алтае. Ее создателем являлся преподобный Макарий. С помощью его миссионерской деятельности стала меняться культурная, духовно-религиозная жизнь коренного населения Алтайского края.

В конце 90-х годов ХХ века в Горно-Алтайске решили возвести храм во имя святого Макария. Поддержку местной православной общине, старостой которой был П.И. Богомолов, в его строительстве оказал мэр города. Возглавив попечительский совет церкви Макария Алтайского (Глухарева), он находил благотворителей, желающих помочь в возведении обители. Строительство началось в 2003 году и длилось до 2007 года.

Здание церкви Макария Алтайского (Глухарева) деревянное. Регулярные службы в храме стали проходить с 2005 года, через год прошло его освящение. В 2010 году при церкви начала действовать воскресная школа. Сегодня настоятелем является иерей отец Павел (Богомолов).