Церковь во имя Успения Божией Матери находится в селе Шебалино. Поселение является административным центром Шебалинского района Республики Алтай, расположено в 120-и километрах от Горно-Алтайска у живописной реки Семы. Заселение этого района началось в 1833 году, по мере увеличения численности русских поселенцев в 1860 году образовалось само село.

Первая церковь во имя Успения Божией Матери была построена в 1899 году с помощью подрядчика Носкова. Представляла собой деревянное однопрестольное, семиглавое здание с двухрядным иконостасом, железной крышей и куполом, высотой около 24 метров. При советской власти обитель была частично разобрана, в помещении до сегодняшних дней расположена спортивная школа.
В 1993 году местные верующие объединились в православную общину. По инициативе старосты Александры Семеновны Челтугашевой администрация выделила им аварийное здание детского сада, которое жители собственными силами привели в порядок, в нем начались богослужения.

В 2010 году началось строительство нового храма, а старое здание после окончания стройки планируется использовать под воскресную школу. С 2013 года настоятелем церкви в честь Успения Божией Матери в селе Шебалино республики Алтай является иерей Вадим Зебницкий.