В купеческой слободе Кяхта в 1810 году решили как символ процветания кяхтинской торговли и символ российской государственности на востоке страны, вместо деревянной церкви возвести каменный храм. Московским архитектором Георгием Герасимовым был разработан проект церкви. В 1830 году был заложен Воскресенский собор с двумя приделами: во имя святителя Николая Чудотворца и во имя Казанской иконы Божией Матери.
Церковь строилась на большие пожертвования. О храме писали, что по внутреннему убранству и богатству он не найдет себе равных в Сибири. В церкви был установлен бронзовый иконостас с хрустальными колоннами и серебряными царскими вратами, огромное паникадило, в центральном приделе были серебряные престол и жертвенник, усеянное цветными камнями евангелие.

В 30 –е годы ХX века как и все православные храмы Воскресенский собор использовался не по назначению. Некоторое время церковь была передана под склад, а затем и вовсе заброшена. Только с 1971 года началась ее реставрация. По плану в ней должны были разместить музей исследования и открытий Юго-Восточной Азии. В 1996 году Воскресенская церковь передана Православной церкви. Ее очистили от мусора, произвели минимальный косметический ремонт. В 2000 году при Вознесенском храме был зарегистрирован приход.

К 350-летию добровольного вхождения Бурятии в состав Российской Федерации в 2011 году планируется проведение полной реставрации Воскресенской церкви. Сейчас богослужения проходят в Казанском южном приделе.