Находится станция Бердск в Новосибирской области в одноименном городе, расположенном на берегу водохранилища к югу от Новосибирска. Основан городок в 1716 году на реке Бердь.

Станция Бердск возникла при строительстве ветки Новониколаевск-Алтайская в 1914 году. В 1915 году была открыта Алтайская железная дорога. Она прошла рядом с селом и связала его быстрым сообщением с Барнаулом и Ново-Николаевском. При её строительстве в 9 километрах от поселения и была открыта остановочная платформа. Вокзал начали строить в 1912 году.

Через станцию Бердск курсируют составы в следующих направлениях: Красноярск, Чита, Бишкек, Барнаул, Алма-Ата, Новый Уренгой, Усть-Каменогорск, Бийск. Расписание поездов содержит время прибытия и отправления, дни следования и графики движения транспорта.

Через станцию Бердск проходят различные грузы: строительные материалы и металлоконструкции, лом черных металлов и лес, уголь и нефтепродукты.